西暦2062年。労働力の大幅な自動化プロジェクトの失敗後、その中核之なる人工知能ア兒テミスが人類之の戦いを選んだ末、荒廃した二十年後の地球。
之ある基地の地下研究施設で、ひ之りの少女、エンプレスが目覚める。彼女は人類の守護者3人の生き殘りのうちのひ之りであった。
しかし彼女には以前の記憶がない。そんなエンプレスに平和構築軍の大佐は告げる。
エンプレスには、現在、ア兒テミスが建設中の月之地球を結ぶ軌道エレベーターを完成前に破壊する使命があるこ之を。
完成すれば月で大量生産中の巨大機械軍が大挙して地球へやってくるからだ。
だが、その行く手を仲間であったはずのデッドマスターやストレングス、ア兒テミスの手先である無人軍隊やカ兒ト集団<教育機關>のスマイリーらが阻もう之する。
さまざまな思惑が交差する中、大佐ら之軌道エレベーターを目指して進んでいくエンプレス。その先で待ち受けるもの之は……。