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清康熙年間,忠臣何大人被將軍紀獻唐陷害,全家抄斬,只有其妻及女玉鳳(黃杏秀)逃脫。玉鳳為救其父,勇闖法場,連殺十三刀斧手,但終不敵受傷,被九難師太(李琳琳)救走。玉鳳因此而得名“十三妹”。另壹忠臣安大人也遭抄家之禍,只有其子安驥
(湯鎮業)逃出生天。安驥與玉鳳自小青梅竹馬,二人於是結伴逃亡。眾人路上巧遇逃婚之玉格格,九難師太洞悉格格乃康熙之胞妹,欲藉此行刺康熙。玉格格(翁美玲)不懂世情,不知身份已被悉穿,反而愛上女扮男裝之玉鳳,弄得壹場笑話。及後名醫李妙生(任達華)之出現,玉格格才將愛意轉於妙生身上。紀獻唐之女紫薇受父命混入玉鳳等人當中作臥底,但紫薇卻與安驥日久生情,因而發生壹段三角戀愛。此時,康熙南下出巡,九難師太部署壹切準備行刺康熙。紀獻唐亦安排天羅地網,欲乘機把玉鳳等人壹網成擒。壹場龍爭虎鬥也因此而展開。